内蒙古自治区社会组织服务中心成立于2013年7月，是由自治区民政厅发起并注册登记的民办非企业单位。中心的宗旨是着眼激发社会组织活力，促进内蒙古自治区社会组织健康有序发展。主要业务范围是协助民间组织管理局做好社会组织登记、年检初审、撤（注）销、档案管理等服务工作；开展社会组织咨询宣传服务工作；承办实施社会组织人员培训工作；协助开展社会组织（包括境外社会组织）活动调研工作；开展社会组织等级评估工作；完成自治区民间组织管理局交办的其他工作等。
中心自成立以来充分发挥职能作用，严格按照核准的章程开展工作，先后承担了中央财政支持社会组织参与社会服务人员培训示范项目、自治区政府向社会组织购买服务中的社会组织等级评估、档案管理等工作。服务能力不断提高，职能作用显现。被中国社会报社表彰为“2014年度社会组织新闻宣传工作先进单位”，被人社厅确定为“内蒙古自治区高校毕业生就业见习基地”。